El desarrollo no saludable de las hojas puede ser un indicio de la deficiencia de cobre. Los síntomas por lo general aparecen en las puntas de las plantas dicotiledóneas, o en los nuevos brotes -llamados vástagos- que brotan de las raíces de los cereales. Las hojas pueden llegar a ser pálidas o amarillentas -una condición conocida como clorosis-. Pueden llegar a ser curvadas o torcidas, sobre todo en las puntas de las hojas. La parte superior de las hojas de los granos de los cereales puede morir y caer. Las hojas de las dicotiledóneas pueden caer – frijoles y manzanos son buenos ejemplos de dicotiledóneas.

Los tallos también muestran signos de deficiencia de cobre, sobre todo en las ramas en desarrollo. En los cereales, los tallos de nuevos brotes pueden mostrar los efectos más pronunciados. Los tallos se vuelven flácidos y muchos vástagos morirán. Los tallos no crecen tan rápido como lo hacen normalmente y su longitud final será más corta de lo habitual. A falta de su firmeza habitual, los tallos pueden doblarse y romperse a medida que se desarrolla la cabeza del grano.

La deficiencia de cobre puede evitar que la fruta se desarrolle normalmente. La fruta puede abortar poco después de que su desarrollo ha comenzado. En los granos de cereales, las cabezas no se desarrollan tan rápidamente como lo hacen normalmente y muchas espiguillas consistirán en pura paja sin grano.

La deficiencia de cobre puede impartir una apariencia enfermiza de retraso en el crecimiento de la planta. Las manchas oscuras que indican la muerte del tejido pueden aparecer en varios lugares. Incluso cuando no aparecen los síntomas patológicos, la deficiencia de cobre retardará el crecimiento de las plantas y la fruta o la producción de cereales se reducirá.